Исследования в области структурной и функциональной геномики высших растений: изучение взаимосвязи организации генетического материала и его экспрессии, молекулярный анализ дифференцировки и морфогенеза растений; анализ структурных и регуляторных генов углеводного метаболизма и синтеза вторичных метаболитов в процессе развития запасающих органов и в условиях стресса; молекулярный анализ геномных полиморфизмов, оценка генетического меж- и внутривидового разнообразия современных растений.
Идентифицированы и охарактеризованы полные последовательности локуса RIN-MC у видов томата, различающихся характеристиками спелого плода. Определена транскрипция двух изоформ RIN1 и RIN2, а также химерного фрагмента RIN-MC. Показано белковое взаимодействие RIN1 и RIN2 с RIN-партнерами, при этом только RIN1 активировал транскрипцию репортерных генов, что согласуется с положительной корреляцией между экспрессией генов-мишеней RIN и RIN1i. Предполагается наличие связи между модификациями гена RIN и его белкового продукта и различием в созревании плода диких зеленоплодных видов томата и красноплодных образцов S. lycopersicum. Выявленная вариабельность промотора RIN-индуцируемых генов могла быть одним из движущих факторов в эволюции признака окраски плода при переходе от зеленоплодных к красноплодным видам томата.
