В соответствии с договором между Федеральное государственное учреждение «Федеральный исследовательский центр «Фундаментальные основы биотехнологии» Российской академии наук» (ФИЦ Биотехнологии РАН) и Федеральное государственное бюджетное образовательное учреждение высшего образования «Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова», биологический факультет в целях подготовки высококвалифицированных кадров по направлениям реализации Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий 8 ноября 2023 года состоится научно-практический семинар «Развитие технологий геномного редактирования для решения инновационных задач промышленных и пищевых биотехнологий» в очном и дистанционном формате.
Программа семинара
8 ноября 2023 г. (среда), 15:00
Москва, биологический факультет МГУ, д.1 стр. 24 (кафедра биофизики, аудитория «Новая»)
15.00 — Начало работы научно-практического семинара.
15.10-15.50 – Хренова Мария Григорьевна «Молекулярное моделирование биохимических реакций», д.ф.-м.н., профессор, профессор РАН, химический факультет МГУ имени М.В.Ломоносова, руководитель группы молекулярного моделирования ФИЦ Биотехнологии РАН
Будет представлен обзор современных методов молекулярного моделирования: классическое и квантовой описание молекулярных систем. Будут даны основы изучения поверхности потенциальной энергии и проведения молекулярно-динамических расчётов.
15.50-16.00 — Дискуссия
16.00-16.40 – Холина Екатерина Георгиевна «Моделирование физико-химических свойств биологических мембран и изучение взаимодействия с ними биоцидов различной природы с помощью метода молекулярной динамики», к.б.н., ассистент кафедры биофизики биологического факультета МГУ имени М.В.Ломоносова
Будут рассмотрены следующие вопросы: крупнозернистое силовое поле Martini для изучения биомолекулярных систем; типы частиц и принципы разбиения полноатомной структуры на крупнозернистые частицы; параметры валентных и невалентных взаимодействий; преимущества и ограничения использования крупнозернистого силового поля Martini; возможности онлайн сервиса CHARMM-GUI; методология создания полноатомных и крупнозернистых моделей бактериальных мембран различного состава, включая модели внешней липополисахаридной и внутренней плазматической мембран; методология создания крупнозернистых моделей антимикробных соединений; знакомство с онлайн сервисом Automated Topology Builder, применяемым для построения полноатомных молекулярно-динамических моделей; разбиение полноатомных молекулярных структур на крупнозернистые частицы и параметризация валентных взаимодействий с помощью автоматических алгоритмов Swarm-CG. Будут рассмотрены молекулярные механизмы действия антисептиков и фотосенсибилизаторов, выявленные с применением молекулярной динамики.
16.40-17.00 – Дискуссия и подведение итогов семинара.
Ответственный за организацию семинара, доцент кафедры синтетической биологии, д.б.н. М.Г.Страховская